9. Religie

Wat ons wat wijzer maakt in de kronieken is dat er een mengeling was van Inca-religie, lokale wakas (heilige plaatsen of objecten), pacariscas (plaatsen van oorsprong) en verering van voorouders. Dit alles was bij overvloed te vinden in bovengrondse begraafplaatsen, die aan de afstammelingen gemakkelijk toegang verleenden tot de mummies. Zoals we later zullen merken hadden graftombes zicht op plaatsen van oorsprong, waardoor de doden verbonden waren met hun plaats van oorsprong. Een overvloed aan bovengrondse graftombes (chullpas), wetende dat het volk de begraafplaatsen bezocht, betekent dat de Chachapoya hun voorouders vereerden, hen geschenken van voedsel en drank brachten en hen in nieuwe textielbundels wikkelden. Belangrijke voorouder-mummies of mallquis, werden wakas en werden vereerd en bezocht door de leden van hun ayllu of familiegroep. Bij de verovering van de Inca's kon het dus gebeuren dat de Inca's de mummies of voorouders van de Chachapoya als gijzelaars meenamen naar Cuzco.

Volgens Garcilaso vereerden de Chachapoya slangen en aanbaden de condor als hun voornaamste god. De enige Chachapoya iconografie die de condor toont is terug te vinden in het mozaïek-fries op gebouw nummer 2 in Gran Pajatén. Afbeeldingen van de slang zijn veel meer terug te vinden op structuren zoals op de top van Mt Shubet en ook op keramiek.